Da eine abschließende Meldung zur Lösung noch fehlt, mische ich auch mal mit.
Bei uns erschien die Meldung nur auf der Konsole, nicht im Log. Das Löschen des Index über den Notes-Dialog schlug fehl, der zugehörige .ft-Ordner verschwand nicht. Also den .ft-Ordner direkt gelöscht und Index neu erstellt. Siehe da: Die Meldung tauchte nicht mehr auf.